济宁校区体育教研室在基础医学院的领导下，全民贯彻党的教育方针，以促进学生健康为工作中心，以《学校体育工作条例》和《全国普通高等学校体育课程教学指导纲要》为指导，负责全校的体育教学、科研、群体竞赛、运动训练和体育场地器材管理等工作，主要承担全校各个专业公共体育必修课的教学，以及《休闲体育》、《体育欣赏》、《体育竞赛组织与编排》和《体育康复》等体育选修课程教学，每年进行数万名的大学生健康体质测试。

  体育教研室成立于1952年，现有专任教师13人，其中副教授5人，讲师6人，助教2人。其中硕士研究生9人，专业方向有：田径、篮球、排球、足球、乒乓球、武术、体操、健美操、柔道等，教研室目前有羽毛球国家级裁判员1人，一级裁判员5人。近5年体育教研室教师住持省部级课题1项，厅级课题6项，中文核心期刊论文4篇，省级以上期刊发表论文50余篇，并根据本校特点参编教材1部，以及多项市级、校级课题。教学比赛获奖情况：2014年山东省高校体育教师基本功大赛获奖，二等奖1名，三等奖4名；2016年山东省高校体育教师基本功大赛获奖，一等奖1名，二等奖1名，三等奖3名；2018年山东省高校体育教师基本功大赛获奖，二等奖1名，三等奖3名。